中草药是我国的文化瑰宝，同时也面临很多争议。有观点认为中草药的活性成分不明确，而西药的药效有完整的临床和试验数据支撑，因此更倾向于选择西药。破译种草药基因组、明确中草药活性成分，是加速中草药产业化的重要手段。年中国科学家屠呦呦因发现青蒿素可以有效治疗疟疾的贡献而获得诺贝尔奖，大大推动了中草药的研究的发展。

随着高通量测序技术的发展，目前已经完成了很多中草药基因组测序，如“仙草”灵芝、复苏植物牛耳草等，研究中草药基因组结构特征，解析中草药重要活性成分的合成通路，是加速中草药的现代化进程的重要途径。

已测序的药用植物统计表